孩子身高矮小可挂以下科室，根据具体原因选择最合适的就诊方向：

儿科内分泌科：这是最常就诊的科室，尤其当怀疑孩子矮小与生长激素缺乏、甲状腺功能减退、性早熟或晚熟等内分泌问题相关时。医生会通过检测生长激素水平、甲状腺激素等，明确病因后，可能采用生长激素、甲状腺素等药物治疗，或结合生长发育评估制定干预方案。例如，若孩子生长速度明显减慢，与同龄人身高差距逐渐拉大，且伴随第二性征发育延迟或体重异常增减，就需优先考虑此科室。

儿科：对于年龄较小的孩子，可先挂儿科进行初步检查。儿科医生会测量身高、体重，绘制生长曲线，评估生长发育状况，判断是否偏离正常范围。同时，会询问病史、饮食及睡眠情况，进行基础检查，初步筛查可能原因，如营养不良、慢性疾病等。若发现问题涉及其他专科，会及时转诊。

遗传代谢科：若孩子存在明显的家族矮小史，或伴随其他代谢异常表现，如特殊面容、智力发育迟缓等，需挂遗传代谢科。该科室通过基因检测、代谢物分析等，排查是否为遗传性疾病(如特纳综合征、软骨发育不全)导致的矮小，以便针对性干预。

骨科：当孩子矮小同时伴有骨骼发育异常，如肢体比例失衡、脊柱畸形、骨龄超前或滞后等，需就诊骨科。骨科医生通过X线检查等评估骨骼发育情况，判断是否因骨骼疾病(如成骨不全)影响生长，必要时采取手术等治疗措施。