孩子矮小可能由生长激素分泌异常、遗传、营养或内分泌等多种因素导致，需通过全面检查明确病因。以下是关键检查项目及分析：

一、基础体格检查

医生会精确测量孩子的身高、体重、坐高、指距等数据，计算生长速率，并与同年龄、同性别正常儿童生长标准曲线对比。同时观察体型、体态，检查第二性征发育情况(如男孩睾丸大小、女孩乳房发育)，排查特殊面容(如眼距宽、鼻梁低平)或骨骼畸形(如脊柱侧弯、O型腿)，初步判断生长发育异常类型。

二、实验室检查

血常规与血生化：排查贫血、肝肾功能异常、血糖/血脂代谢紊乱等可能影响生长的全身性疾病。

甲状腺功能检测：通过测定甲状腺素(T3、T4)和促甲状腺激素(TSH)，排除甲状腺功能减退(导致代谢率下降、骨骼发育迟缓)或亢进(可能引发骨龄提前)。

性激素检测：针对性发育异常(如性早熟或延迟)的孩子，评估雌激素、睾酮水平，判断性发育对身高的影响。

生长激素激发试验：通过药物刺激(如胰岛素、精氨酸)，观察生长激素分泌峰值。若峰值低于正常值(通常<10ng/mL)，提示生长激素缺乏，需进一步排查垂体功能。

胰岛素样生长因子-1(IGF-1)及结合蛋白-3(IGFBP-3)检测：反映生长激素的生物学效应，辅助判断生长激素分泌状态及作用效率。

三、影像学检查

骨龄评估：拍摄左手腕部X光片，观察骨化中心发育程度，判断骨龄与实际年龄的差异。若骨龄落后2岁以上，可能提示生长激素缺乏或甲状腺功能减退;骨龄提前则需警惕性早熟。

头颅MRI或CT：怀疑下丘脑-垂体病变(如肿瘤、囊肿)时，检查脑部结构，排查影响生长激素分泌的颅内异常。

长骨X线：观察骨骼形态，排查软骨发育不全等骨骼发育异常疾病。

四、遗传与基因检测

染色体核型分析：针对女孩，尤其是伴有特殊体征(如颈蹼、肘外翻)或性发育异常者，排查特纳综合征(X染色体缺失)等染色体疾病。

基因检测：怀疑遗传因素(如家族性矮小、SHOX基因缺失)时，检测与生长发育相关基因，明确病因并评估遗传风险。

五、其他检查

根据孩子具体情况，可能需进行血糖测定、血气分析、营养评估(如维生素D、钙摄入情况)或家族遗传咨询，以排除代谢性疾病、营养不良或家族性生长障碍。